U dvanaesniku nalazimo sve slojeve karakteristične za probavnu cijev. Sluznica: lamina epitelijalis (jednoslojni visokoprizmatični epitel s pokojom vrčastom stanicom), lamina proprija: crijevne žlijezde (Lieberkϋhnove kripte) – podužni i poprečni presjek, lamina muskularis mukoze. Podsluznica: razgranate, zavijene, tubulusne, mukozne (Brunnerove) duodenalne žlijezde (gll. submucosae intestinales s. duodenales) koje se otvaraju u crijevne žlijezde. Mišićni sloj, seroza.